A mátrixrendszerek fenntartása drágább, mint a hagyományos humánerőforrás-szisztémáké, ám hatékonyságuk miatt kifizetődőek, állítják a szakértők. A multinacionális nagyvállalatoknál szinte már csak mátrixrendszerrel találkozhatunk, ám azért ennek is vannak hátulütői: a döcögő bürokrácia miatt, vagy ha a vezetők között nincs összhang, a szisztéma nem lesz sikeres.