A katonai ügyészség vádirata szerint 2003 júniusában Bácskai, aki akkor a maffiaellenes központ főigazgatója volt, Kulcsár Attila kérésére közbenjárt azért, hogy a rendőrség előtt rejtve maradjanak a bróker által elkövetett pénzügyi visszaélések, és ennek érdekében magas rangú rendőrtiszteket próbált megtéveszteni. Korábban az első fokú bíróság bűnösnek találta a volt tábornokot, de az ítélőtábla megalapozatlanság és eljárási szabálysértések miatt hatályon kívül helyezte a nem jogerős döntést, és a megismételt eljárás lefolytatására a Csongrád Megyei Bíróság Katonai Tanácsát jelölte ki. Bácskai János tagadta az ellene felhozott vádakat.
