A szervezet által kiadott jelentés (Amnesty International Report 2004) szerint, amely több száz ország eseteit dolgozza fel, a terrorizmus elleni harccal párhuzamosan bevezetett intézkedések kevesebbet javítottak a biztonságon, mint amennyit rontottak a szabadság intézményén. Véleményük szerint a szeptember 11.-i terrortámadások óta az USA teljesen semmibe veszi az emberi jogokat, és kívül helyezi magát mindenféle számonkérhetőségen.
Az Egyesült Államok mellett más országokat is bírálat ért, például a terrorcselekményekkel kapcsolatban hozott gyanúsítottakkal kapcsolatos bánásmód miatt. Az AI szerint a koalíciós erők nem tudtak megfelelni felvállalt kötelezettségeinek, a civil áldozatok az általuk alkalmazott túlzott katonai erő alkalmazásának tudhatók be. Véleményük szerint az is nagy problémát jelent, hogy az iraki háború eltereli a figyelmet más területek, például Kolumbiában vagy Afrikában folyó súlyos visszaélésekről.
