Újabb élvonalbeli játékossal erősítette meg keretét az immár Pintér Attila által irányított Puskás Akadémia. A másodosztály listavezetője hivatalos oldalán jelentette be, hogy leigazolta a Haladás 20 éves védőjét, Hegedűs Jánost.
A hátvéd 2013 januárjában a Budaörstől került a szombathelyiekhez, az NB I futó szezonjában 16 mérkőzésen összesen 1438 percnyi játéklehetőséget kapott Mészöly Gézától. A szezon során egy gólt és egy gólpasszt jegyzett az MTK, illetve a Ferencváros ellen.
Hegedűs három és fél évre írt alá. Ő a gárda harmadik téli szerzeménye, a Fraditól érkező Gyömbér Gábor, valamint a honvédos Prosser Dániel után.
