Rengeteget tanultam, jó barátokat szereztem és csodálatos élményekkel gazdagodtam a labdarúgásban. Egyáltalán nem volt könnyű meghoznom a döntést, de ilyen az élet. Most itt az ideje, hogy szembenézzek életem egy új korszakával
– írta a spanyol válogatott honlapján kedden megjelent búcsúüzenetében a középhátvéd.
Marchena a Sevilla csapatában kezdte profi pályafutását, majd a portugál Benfica színeiben szerepelt, 2001-ben pedig a Valencia igazolta le. Spanyol bajnoki címet kétszer, Király Kupát és UEFA Kupát egy-egy alkalommal nyert. Később a Villarreal és a Deportivo La Coruna együttesében, legutóbb pedig Indiában futballozott.
A spanyol válogatottban 2002 és 2011 között 69 meccsen lépett pályára és tagja volt a 2008-ban Európa-, két évvel később pedig világbajnokságot nyerő csapatnak.