Az emberi erőforrások egykori csúcsminisztere belső elhívással magyarázza a Népszavának, hogy visszatért egyházához, ahol már dunamelléki református püspök és a zsinat lelkészi elnöke. Balog Zoltán azt állítja, most sem gyengébb az emberi jogok védelme, mint tíz vagy húsz éve. Ő 2006 őszét tartja emberi jogi szempontból az újkori magyar demokrácia mélypontjának.
Az interjúban kitérő választ ad arra, egyházi vezetőként feladatának érzi-e a fellépést a gyűlöletkeltő kormányzati kampányok ellen.
A politikának általában szüksége van ellenségképre, mert ez a szomorú világ alakult ki. Negatív indulatokból könnyebb szavazatokat csiholni, mint pozitív üzenetekből.
A homofób gyermekvédelmi törvényről egyháza 2004-es állásfoglalása alapján azt mondja, ők a homoszexuális hajlamot nem minősik, a homoszexuális kapcsolatot nem fogadják el.
Az Úristennek és tanítványainak gyűlölniük kell a bűnt, de szeretniük kell a bűnöst.
Balog Zoltán szerint a törvény nem mossa össze a pedofíliát a homoszexualitással, mert ő abban azt olvasta, hogy
a 18 éven aluliak körében korlátok közé szorítja a homoszexualitás népszerűsítését. Ezzel én teljes mértékig egyetértek.
Orbán Viktorral jó viszonyban van, vele is szokott mély beszélgetést folytatni hitbéli kérdésekről. Egykori politikusként óvna mindenkit a politikusok démonizálásától, püspökként a gyülekezetekben pedig azt tapasztalja, elvárják, hogy egyháza ne politizáljon.