Az 1969-ben Salgótarjánban született szakember edzői pályafutását a Diósgyőri VTK-nál kezdte, ahol 2010 és 2012 között az első csapatot is irányította.
A Puskás Akadémiához 2012 nyarán került, és első évében mindjárt az élvonalba vezette a felcsútiakat, a következő két évadban pedig sikerült az első osztályban tartania a csapatot.
Benczés Miklós 2015 nyarán távozott Felcsútról, vezetőedzőként dolgozott a Mezőkövesdnél, majd 2016-tól mostanáig a DVTK regionális utánpótlás szakmai igazgatójaként tevékenykedett.
Az edző kettő plusz egyéves szerződést írt alá a most véget ért szezonban kupadöntőt játszó és a bajnokságban hatodik helyen záró Puskás Akadémiánál.
