A középhátvéd összesen 102 alkalommal lépett pályára a dél-amerikai ország nemzeti együttesében, amellyel a 2014-es világbajnokságon a negyeddöntőig jutott, míg 2001-ben Copa Americát nyert.
Továbbra is szeretnék valamilyen módon a labdarúgásban tevékenykedni, mivel edzői végzettségem is van
– nyilatkozta Yepes, aki hazájában a Cortulua és a Deportivo Cali, külföldön pedig előbb az argentin River Plate, majd a francia Nantes és Paris Saint-Germain játékosa volt.
Olaszországban is futballozott, megfordult a Chievo, az AC Milan és az Atalanta együttesében is. Utolsó klubcsapata az argentin San Lorenzo volt.
