Egy izraeli tisztviselő szerint minden fogvatartottat hazajuttatnak Izrael költségén, viszont ehhez az aktivistáknak be kell mutatniuk személyazonosító okmányaikat. A közlemény szerint a kihallgatások nem eredményeztek olyan információkat, amelyeket a bíróságon fel lehetne használni, így az aktivistákat nem pereli be a zsidó állam.
Izrael azután döntött a foglyok szabadon engedése mellett, hogy az izraeli hadseregétől merőben eltérő információk láttak napvilágot a kilenc emberéletet követelő katonai akcióról. A segélyhajó egyes utasai szerint ugyanis az izraeli kommandósok megrohamozták a hajót, ezután éles fegyverekkel, illetve elektromos sokkoló pisztolyokkal az utasokra lőttek.
Az izraeli hadsereg álláspontja szerint viszont épp a segélyhajón utazó aktivisták provokálták az erőszakot, és bizonyítékul videofelvételeket tettek közzé az incidensről. Eszerint a kommandósok lincselés áldozatai voltak, és csak önvédelemből kényszerültek éles fegyverek bevetésére.
