A Napi Gazdaság értesülése szerint a svájci alap körül történt esetleges visszaélésekről vizsgálódik a Miniszterelnökség. A szabálytalansági eljárást azzal indokolják, hogy a források elszámolásánál kettős finanszírozás állhat fenn, de a támogatott alapítványok ezt nem ismerik el. Az érintett szervezetek együttműködnek az illetékesekkel, szerintük a szabálytalanságok mögött nincs valódi cselekmény, legfeljebb adminisztratív hibák történhettek.
A pályázati pénzek kezelői a Norvég Civil Alappal kapcsolatban hasonló szerepet betöltő Ökotárs Alapítvány, Demokratikus Jogok Fejlesztéséért Alapítvány, Autonómia Alapítvány és a Kárpátok Alapítvány. A miniszterelnökségi gyanú szerint a mintegy 1,3 milliárd forintot kezelő konzorcium a pályázati költségek számláit mind a Svájci-Magyar Civil és Ösztöndíj Alapprogram, mind pedig a Norvég Civil Támogatási Alap felé benyújtotta.
A Miniszterelnökség vizsgálata legfeljebb 45 napig tarthat, addig viszont nem juthatnak pénzükhöz a nyertes szervezetek. Közel harminc projekt már augusztus 11-e óta vár a soron következő részforrásokra, ezek elmaradásával több tucat már megkezdett programot fel kellett függeszteni.