Csakúgy, mint eddig minden alkalommal, a helyhatósági választással egy időben választják meg a kisebbségi önkormányzatok tagjait is. A választás módja azonban több ponton eltér az eddigiektől: egy 2005-ben elfogadott törvénymódosítás szerint ugyanis szűkítették a választók és választhatók körét. Eddig ugyanis bármelyik magyar állampolgár szavazhatott a kisebbségi önkormányzati képviselőkre, és valamennyi magyar állampolgár választható volt, feltéve, ha kijelenti az adott kisebbséghez tartozását. Ennek azonban semmilyen egyéb kritériuma nem volt, így előfordult, hogy egymást követő két ciklusban valaki örmény majd roma kisebbségi képviselő lett. 2006-tól az új szabályok értelmében csak az szavazhat és csak az választható, aki felvételét kérte a kisebbségi névjegyzékbe.
A kisebbségi törvény értelmében ha az adott kisebbség megfelelő számú települési önkormányzattal rendelkezik, 2007 márciusában területi és országos önkormányzatot hozhat létre.
Területi önkormányzatok
A területi és országos önkormányzatot a települési kisebbségi önkormányzati képviselők (elektorok) választják. A területi kisebbségi önkormányzati választásokon választó és választható, aki települési kisebbségi önkormányzat tagja (azaz: elektor). A választást akkor kell tűzni, ha a megye területén legalább 10 településen, illetőleg a fővárosban legalább 10 kerületben települési kisebbségi önkormányzat működik.
A területi kisebbségi önkormányzatok kilenctagú képviselő-testülete lehetővé teszi a működőképességet és a hatékony munkavégzést, a megyei, illetőleg a fővárosi érdekviszonyok megjelenítését. Az a jelölő szervezet állíthat listát, amely a megyében (fővárosban) a megválasztott elektorok legalább 10 százalékát jelöltként állította a települési kisebbségi önkormányzati választáson. A választást akkor lehet megtartani, ha a jelölő szervezetek által állított listákon összesen legalább kilenc jelölt van.
Elméletileg lehetséges, hogy a jelölő szervezetek listáin nincs annyi jelölt, amennyi a megválasztható képviselők száma. Ebben az esetben a területi kisebbségi önkormányzati választást nem lehet megtartani.
Az elektor egy listára szavazhat. A törvény – az arányosság érdekében – törekszik arra, hogy a jelölő szervezetek olyan arányban részesüljenek a mandátumokból, mint amilyen arányban részesültek a szavazatokból. Ezt a célt szolgálja a mandátumkiosztás módszere és az, hogy mandátumszerzési küszöböt nem alkalmaznak.
Az országos önkormányzat
Az országos kisebbségi önkormányzati képviselők választását ki kell tűzni, ha országosan legalább 4 települési kisebbségi önkormányzat működik. A közgyűlés tagjainak száma legalább 15 fő (ha a megalakult települési kisebbségi önkormányzatok száma nem több mint 15) és legfeljebb 53 fő (ha a megalakult települési kisebbségi önkormányzatok száma több mint 200). A választást akkor lehet megtartani, ha a jelölő szervezetek által állított listákon összesen legalább annyi jelölt van, mint a megválasztható közgyűlési tagok száma.
