Az Állami Számvevőszék (ÁSZ) szerint 2000-ben és 2001-ben 1,3 milliárd forintot fizettek ki az IKA-nál szabálytalanul kiírt pályázatok nyomán, míg 2002-ben és 2003-ban – ráadásul a kötelező pályáztatások mellőzésével – további 1,5 milliárdot.
A szabálytalanságok két alaptípusra oszthatók. Az egyik az úgynevezett Illyés-kassza felhasználásának a rendszere. Ezek az állami pénzek hosszú éveken át tulajdonképpen egyfajta „feketekasszaként” működtek és a határon túli magyar kisebbségi vezetők anyaországi tartózkodásának költségeit fedezték belőle.
A másik a kisebbségi támogatások odaítélése. Már annak idején is nagy port vert fel például a Székelyföldi Médiacentrum ügye. A fő kifogás az volt, hogy a médiacentrum céljára vásárolt ingatlan lényegesen kevesebbet ért, mint a vételárként feltüntetett összeg.
Hadnagy Miklós, az Illyés-alapítvány irodavezetője az ÁSZ-jelentéssel kapcsolatban kifejette számos olyan belső működési problémára hívja fel a figyelmet ajelentés, aminek megoldása már évek óta lehetséges lett volna.
