Az APEH nyomozó hivatalai a törvény által hatáskörükbe utalt bűncselekmények nyomozását végzik. Ezek a következők:
Jogosulatlan gazdasági előny megszerzése
Számviteli fegyelem megsértése
Csődbűntett
Adó- és tb-csalás
Munkanélküliek szolidaritási alapjába való befizetési kötelezettség megszegése
Tb- vagy nyugdíjjárulék fizetési kötelezettség megsértése
Csalás (ha az APEH hatáskörébe tartozó adóra, járulékra vagy költségvetési támogatásra követik el)
Közokirat-, illetve magánokirat-hamisítás, ha a fenti bűncselekményekkel összefüggésben követik el
