A megállapodás alapján a város öt kulcsprojektje 31,14 milliárd forint európai uniós és hazai forráshoz juthat 2007 és 2009 között. A kormányzat EU-s és hazai forrásokból Pécs öt kulcsprojektjének 34,6 milliárdos összköltségének 90 százalékát, míg Pécs önkormányzata ennek 10 százalékát biztosítja.
A miniszterek vállalják, hogy az EU strukturális alapjaiból odaítélhető források tervezésénél az EU-hoz benyújtandó Nemzeti Stratégiai Referenciakereten belül kiemelten szerepeltetik majd Pécs öt kulcsprojektjét, a keleti városrész rehabilitációját, a Zsolnay-Balokány kulturális turisztikai negyed kialakítását, a Zenei és Konferenciaközpont építését, a „Dél-Dunántúli Tudásközpont” kialakítását, az ún. „Nagy Kiállítótér” felépítését, valamint a közterek és parkok rehabilitációját.