Az FVM közleménye szerint az Európai Unió bizottságaiban folyamatosan tárgyalnak a GMO-k engedélyezésének feltételeiről, a természetes környezetre gyakorolt hatásáról. Magyarországon jelenleg a genetikailag módosított növényfajták köztermesztésben történő felhasználása nem engedélyezett.
A géntechnológiai tevékenységet szabályozó törvényt az Európai Unió irányelvének elfogadását követően az Országgyűlés 2003-ban módosította. A jelenleg hatályos rendelkezések a géntechnológiával módosított szervezetek szabad környezetbe való kibocsátását, kereskedelmének feltételeit szigorú előírásokhoz kötik.
Az ilyen növényfajták külön engedély alapján kizárólag kísérleti célra használhatók. Az engedély megadására a Géntechnológiai Eljárásokat Véleményező Bizottság javaslata alapján, az FVM, mint géntechnológiai hatóság jogosult.
A genetikailag módosított összetevőt tartalmazó élelmiszerek vonatkozásában az élelmiszerekről szóló törvény, valamint annak végrehajtásáról szóló rendelet az irányadó. Ezen élelmiszerek forgalmazása szigorú vizsgálatokhoz kötött.
A szabályozás előírja, hogy a genetikailag módosított szervezetből álló, illetve ilyen szervezetet részben vagy egészben tartalmazó termékeket az előállító, valamint forgalmazó köteles megjelölni. A csomagoláson, valamint a termék minőségét tanúsító okmányon fel kell tüntetni, ha a termék GMO-t tartalmaz.
Az Európai Unió engedélyezési eljárásában a tagállamok nemzeti szinten környezeti hatástanulmány elvégzésével vizsgálhatják, hogy adott genetikailag módosított szervezet köztermesztésbe vonása, adott régióban jelent-e környezeti veszélyt.