A Zalán érkezik a Balatonba a legtöbb víz, így nem csoda, hogy a szennyezés nagy része is a torkolatnál kerül Közép-Európa legnagyobb tavába.
A Keszthelyi-öböl helyzete azért súlyos, mert ide kerül a tóba jutó össz-szennyezés egyharmada, míg az öböl vízfelülete a Balatonénak csupán egyötöde, térfogata csak egyhuszonötöd része. A szennyezés – lebegőanyag, foszfor, nitrogén – megfogásában fontos szerepet játszik a nyolcvanas évek elején kialakított Kis-Balaton vízvédelmi rendszer első üteme. Ennek köszönhetően a víz minősége az elmúlt évtizedekben jelentősen javult.
A légi felvételeken szépen elválik egymástól a befolyó víz és a tó vize.