Az állami gyászszertartáson Biskekben mintegy 20 ezer ember vett végső búcsút az elhunyttól.
A nemzeti filharmonikusok csarnokában felállított ravatalnál ezrek tisztelegtek emléke előtt. A gyászolók közül sokan kirgiz népviseletben voltak. A nagy tülekedés miatt a rendőrök átmenetileg le is zárták az épületet, a ravatalhoz ugyanis jó három órát kellett sorban állni a csaknem 40 fokos rekkenő hőségben.
Kurmanbek Bakijev kirgiz elnök gyászbeszédében olyan emberként méltatta az írót, aki az egész világ számára a kirgiz kultúrát és történelmet testesítette meg. Dmitrij Medvegyev orosz államfő részvéttáviratban fejezte ki az elhunyt iránti nagyrabecsülését.
Ajtmatovot katonai díszőrséggel kísérték utolsó útjára. A vörös-sárga kirgiz nemzeti zászlóba burkolt holttestet muzulmán szokás szerint helyezték végső nyugalomra a fővárostól 20 kilométerre lévő Ata Beit emlékhelyen. Kívánságának megfelelően a sztálini tisztogatások idején kivégzett apja mellett temették el.
